Análisis de los sitios de unión de la ivermectina en la estructura de importinas α humanas

Sitios de unión de la ivermectina en importinas α

Autores/as

  • Elvio Gayozo Universidad Nacional de Asunción, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Departamento de Biología, San Lorenzo, Paraguay
  • Laura Rojas Aguadé Universidad Nacional de Asunción, Facultad de Ciencias Químicas, Departamento de Microbiología Industrial, San Lorenzo, Paraguay
  • Julio Barrios Leiva Universidad Nacional de Asunción, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Departamento de Biotecnología, San Lorenzo, Paraguay

DOI:

https://doi.org/10.47993/gmb.v47i1.791

Palabras clave:

Antiparasitario, carioferinas, dominio proteico, biología computacional

Resumen

Resumen: La ivermectina ha demostrado importantes actividades antivirales in vitro contra numerosos virus de ARN, inclusive contra el virus del SARS-CoV-2. Se ha descrito que la ivermectina inhibe la actividad del heterodímero importina α/β1, sin embargo, se desconoce los sitios específicos blancos de interacción de la molécula.

Objetivos:  En este estudio se llevó a cabo el análisis in silico de los sitios de unión de la molécula de ivermectina en interacción con la estructura de la importina α humana, utilizando la estrategia del acoplamiento molecular.

Métodos:  Se realizaron simulaciones del acoplamiento utilizando un modelo semiflexible y el algoritmo Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno entre las estructuras de ivermectina y la importina α.

Resultados:  Los datos obtenidos revelan una mayor afinidad de interacción de la ivermectina en los dominios ARM2-ARM4 (sitio mayor de unión) de las importinas α humanas, con energías de unión favorables de -9,5 a -8,0 kcal.mol-1. Los residuos activos de mayor importancia en las interacciones fueron los residuos Triptófano, Asparagina y Arginina, los cuales también son fundamentales para el reconocimiento de secuencias NLS (secuencias de localización nuclear) de las proteínas virales. También se registró afinidades por los dominios H1-ARM5, H2-ARM6 y H2-ARM7, con energía de unión de -7,5 kcal.mol-1.

Conclusiones:  Los resultados de este estudio evidencian que la molécula de ivermectina presenta afinidades de unión favorables al sitio mayor de unión (ARM2-ARM4) de las importinas α humanas la cual es una región importante de unión a proteínas virales.

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Publicado

2024-05-22

Cómo citar

1.
Gayozo E, Rojas Aguadé L, Barrios Leiva J. Análisis de los sitios de unión de la ivermectina en la estructura de importinas α humanas: Sitios de unión de la ivermectina en importinas α. GMB [Internet]. 22 de mayo de 2024 [citado 14 de junio de 2024];47(1):27-32. Disponible en: http://www.gacetamedicaboliviana.com/index.php/gmb/article/view/791

Número

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Artículos Originales